■結論から

テバイードの塔だけで強化するのに最も適した魔法石の組み合わせ

【使用素材】
　 ザクレタ　　　ＨＰ９０、力１８０　　　　　　　魔術師のピアス・司教の腕輪　　入手量普通
　 スプリーム　　ＨＰ４６、知恵１３５　　　　　　悪魔の角・盗賊の血　　　　　　　入手量大量
　 アンカーズ　　信仰心９０、敏捷度２７０　巨人の血・僧侶の髪　　　　　　　　入手量普通
　 ザクルド　　　信仰心４５、生命力１８０　　昆虫の卵・折れた剣　　　　　　　　入手量普通
　 リカバー　　　力９０、幸運度２７０　　　　　霊魂・天使の羽　　　　　　　　　　　入手量少なめ
残りの素材で
　 デュレイ　　　信仰心９０ 　妖魔の笛・ ドラゴンテイル　妖魔の笛・ 竜のウロコ 　入手少ない

【合計値】
　 ＨＰ１３６、 力２７０、知恵１３５、信仰心１３５（２２５）、生命力１８０、敏捷度２７０、幸運度２７０

なぜそうなったか理由は以下の説明を参照下さい。回りくどいので読まなくてもＯＫです。
もっと効率のいい方法をご自分で見つけたい方は、ヒントくらいにはなると思います。

■プラン１.「テバイードの塔の合成素材」だけでオートマターを強化する

目的 ： テバイードの塔だけで、入手可能な素材で精製した魔法石で、オートマターを強化します。
長所 ： いちいち いろいろな場所をまわって 素材 を集めるのが面倒な場合に有効。
　　　　 平均的に上昇させるので、９９９を越えてループする危険を減らす。
短所 ： とはいえ組み合わせが限られてくるため、能力値に若干ムラが出る。あとで調整が必要。

まずテバイードの塔の合成素材の入手難度を（入手易Ａ　〜　Ｆ入手難）で評価します。
（おおよその目安）
　 Ａ．　折れた剣、悪魔の角、盗賊の血、忍者の頭巾
　 Ｂ．　巨人の血、昆虫の卵、侍のヒゲ、司教の腕輪、僧侶の髪、天使の羽、魔術師のピアス
　 Ｃ．　霊魂、スライムゼリー
　 Ｄ．　吸血鬼の爪
　 Ｅ．　ドラゴンテイル、妖魔の笛、竜のウロコ
　 Ｆ．　死竜の翼

入手期待値をパーセント比率であらわすと
　 Ａ ： Ｂ ： Ｃ ： Ｄ ： Ｅ ： Ｆ 　＝　５２ ： ２２ ： １２ ： ８ ： ３ ： １　
素材０で テバイードの塔探索 を開始して、帰還、錬金術ギルドへ行くと、これくらいの量になっていると思います。
（これは正確なデータによるものではなく、経験によるものであくまで目安です。）
これをふまえて、上昇値が高い魔法石を探します。
以下の表はテバイードの塔で比較的大量に採取できるＡ、Ｂ、Ｃ の組み合わせです。

これを参考にまんべんなく上昇、なおかつ素材同士が かぶらない組み合わせを探します。
（上と同じ）
【使用素材】
　 ザクレタ　　　ＨＰ９０、力１８０　　　　　　　魔術師のピアス・司教の腕輪　　入手量普通
　 スプリーム　　ＨＰ４６、知恵１３５　　　　　　悪魔の角・盗賊の血　　　　　　　入手量大量
　 アンカーズ　　信仰心９０、敏捷度２７０　巨人の血・僧侶の髪　　　　　　　　入手量普通
　 ザクルド　　　信仰心４５、生命力１８０　　昆虫の卵・折れた剣　　　　　　　　入手量普通
　 リカバー　　　力９０、幸運度２７０　　　　　霊魂・天使の羽　　　　　　　　　　　入手量少なめ
残りの素材で
　 デュレイ　　　信仰心９０ 　妖魔の笛・ ドラゴンテイル　妖魔の笛・ 竜のウロコ 　入手少ない

【合計値】
　 ＨＰ１３６、 力２７０、知恵１３５、信仰心１３５（２２５）、生命力１８０、敏捷度２７０、幸運度２７０

これは一個ずつ使用した場合で、実際の上昇値は入手量にも影響されます。
だいたい平均的に上げることはできますが、やはり多少のムラはできると思います。
（おそらく生命力の上昇が遅れます）

これが限界のようです。もっと平均的に上昇させる組み合わせがありましたらご連絡下さい。